第二军医大学出版社于1997年经国家新闻出版署批准成立，出版发行本校设置的学科、专业课程所需教材及教学参考书、教学工具书；与本校主要专业方向一致的学术专著、译著；以及医学科普读物等相关实用性图书。为振兴医学教育和出版事业不懈努力，为社会主义物质文明和精神文明建设服务。

第二军医大学出版社建社以来，已出版图书500余种，有多部学术著作获奖，如《肝胆病理学》、《实用外科重症监护与治疗》、《神经肽基础与临床》分别获第二、三、四届“中国人民解放军图书奖”，多本图书获第四、五届华东地区大学出版社优秀教材学术专著一等奖和二等奖。《护理心理学》等获全国高校优秀畅销书奖。